量子化学

schrodinger suites计算化学工作站选择

2022-04-26 22:52:49 gx 25

Schrodinger是计算化学领域为生命科学和材料研究提供解决方案领先者,

用于研究医学结构的辅助工具,用户可以通过多种技术来快速制图模型,并且提供不同的模拟环境,便于用户来观察研究。


软件的目的是为用户提供强大的功能和最先进的技术,他们设计和开发药物所需的一切,以及分子建模、药物设计和制造方面的研究人员。


环境相关材料化学结构的快速构建提供了简洁友好的环境,并支持各种相关的计算操作。


一般来说,分子和化学结构建模,生物和生物结构建模,图形渲染和数值变化建模,图形和简单的应用环境,不同材料在不同环境条件下的行为。


包括评估和分析,原子研究。对水位的材料和模型结构进行各种化学计算,数据显示在各种表格和图形中。

图片关键词

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Schrodinger是世界一流的分子建模、药物设计和材料科学软件集合,


由AutoQSAR,Demond,FEP+、Maesrto 、MS Combi、MS Jaguar、Bioluminate、KNIME Extensions、Canvas、Glide、WaterMap等软件组合而成.

其中:

  • 药物发现:包含从头设计、虚拟筛选、等级顺序化合物、结构细化和准备、可视化和工作流程、生物制剂建模等,

  • 材料科学:原子级仿真可以帮助您在开始合成和测试之前确定最有前途的结构和成分,从而可以加快新材料的开发。

  • 从有机电子产品到特种化学品再到聚合物制造


1、生物制剂试剂盒

从头开始设计,这个易于使用的新套件是第一个完整的所有工具集合,这些工具对于建模生物制剂、抗体和蛋白质很重要。

2、材料科学套件

这个创新的新套件为基于量子力学的化学系统模拟提供了强大的多功能工具。它可以应用于特殊的化学和材料科学系统。

3、发现信息学套件

用于协作药物设计的下一代平台允许医学化学家、生物学家、建模师、IT 专业人员和其他人员的跨学科团队实时共享、查看和管理数据。

4、PyMOL

PyMOL 是一个基于开源的用户赞助的分子可视化系统。通过购买维护和支持订阅来支持此类开放、有效且价格合理的软件的开发。


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Schrodinger Desmond高性能分子动力学模拟
Desmond结合了速度和准确性,可以进行长时间的分子动力学模拟,从而使用户可以检查具有重要生物学和药学意义的事件。

Desmond与Maestro无缝集成,可提供全面的设置,仿真和分析工具,支持GPU加速
FEP +用于药物发现的高性能自由能计算FEP +结合了非常精确的力场(OPLS3e)和改进的采样算法,这些采样算法利用GPU的高性能提供了前所未有的精度来提供结合自由能,为启用结构的药物发现项目提供了重要价值。
DeepChem是一个python库,可提供高质量的开源工具链,用于在药物发现,材料科学,量子化学和生物学方面进行深度学习

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Schrodinger软件系统与硬件配置要求

(1)高性能分子动力模拟超算GPU卡要求


A1 服务器级可选:Tesla 系列(A100、V100、T4)
A2工作站级可选:Quadro P5000、RTX5000


GPU卡技术参数:



(2)分子建模与可视化分析配置要求


显示设备:nvidia 3D Vision(四缓冲、OpenGL硬件立体显示)、Zalman 3D 显示器,100Hz刷新率
图形APP:支持OpenGL2.1或更高

(3)支持操作系统


RedHat企业版(RHEL) 6.8-6.10  7.4-7.6
Centos 6.8-6.10 7.4-7.6
Ubuntu 16.04 LTS  18.04 LTS
SUSE  SLES/SLED 15, SLES/SLED 12SP4

(4)支持GPU加速的Schrodinger软件包
    Desmond MD---高性能分子动力模拟
    FEP+ ---用于药物发现高性能自由能计算
    WaterMAP ---配体优化的新范式
    GPU Shape ---形状筛分(快速高效的基于形状的叠加和相似度搜索工具)
    AutoQSAR/DeepChem ---适用于大数据应用的可扩展,直观,深度学习的QSAR模型



价格备注配置规格
4-5WMD计算,分子建模8核@5.0GHz/64GBDDR4/Quadro P5000 16GB/960GB SSD+4TB 企业级HDD/塔式(750w)
6-7WMD计算,分子建模12核@4.5GHz/96GB DDR4/RTX 5000 16GB/960GB SSD+6TB 企业级HDD/塔式(750w) 
8-9WMD计算,分子建模18核@4.2GHz/128GB DDR4/2*RTX 5000 16GB/960GB SSD+6TB 企业级HDD/塔式(750w) 
7-8WMD计算2颗Xeon金牌5218处理器(32核@2.6GHz)96GB DDR4/RTX 5000 16GB/960GB SSD+4TB 企业级HDD/塔式(865w) 
9-10WMD计算2颗Xeon金牌5218处理器(32核@2.6GHz)128GB DDR4/双RTX500016GB/1.9TB SSD+6TB 企业级HDD/塔式(865w) 
15-16WMD计算2颗Xeon金牌5218处理器(32核@2.6GHz)192GB DDR4/4*RTX5000 16GB/3.84TB SSD+8TB 企业级HDD/双塔式(2000w)


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